El volante colombiano de River Plate acumula nueve encuentros en Copas del Mundo. Con su ingreso ante Ghana en el Mundial 2026, quedó a una aparición de empatar el registro histórico de Carlos Valderrama y Freddy Rincón.
La victoria de Colombia sobre Ghana por los dieciseisavos de final del Mundial de Estados Unidos, México y Canadá 2026 representó la cuarta ocasión en que la selección cafetera alcanzó los octavos de final en siete participaciones mundialistas.
El resultado, un 1-0 en Kansas City, se definió con un gol de Jhon Arias en el primer tiempo. Durante la pausa de hidratación del segundo tiempo, Arias abandonó el campo y fue reemplazado por Juan Fernando Quintero.
Con su ingreso, Quintero disputó su noveno partido en Mundiales. Quedó a un encuentro de igualar la marca de Carlos Valderrama y Freddy Rincón como el segundo colombiano con más apariciones en el torneo. Ambos jugadores participaron en las tres ediciones consecutivas de Italia 1990, Estados Unidos 1994 y Francia 1998.
El debut de Quintero en una Copa del Mundo fue en Brasil 2014, cuando ingresó al minuto 53 ante Costa de Marfil y anotó el 2-0 definitivo 17 minutos después. Fue su primer gol con la selección. Luego fue titular ante Japón, y Colombia llegó hasta cuartos de final, donde perdió 2-1 ante el anfitrión.
En Rusia 2018, Quintero anotó un tiro libre ante Japón, elegido como el segundo mejor gol del torneo. Sumó dos asistencias ante Polonia y Senegal, y Colombia fue eliminada en octavos de final por Inglaterra en penales.
En el Mundial 2026, Quintero ha tenido un rol de impacto desde el banco. No jugó ante Uzbekistán. Ingresó ante República Democrática del Congo y generó la jugada del gol de Daniel Muñoz. Ante Portugal, entró al minuto 76 en un 0-0. Frente a Ghana, ingresó al minuto 73 y remató de larga distancia al 84 sin éxito.